El templo parroquial

El primitivo templo parroquial –del que nada sabemos– se localizaba en el mismo solar del actual, es decir, como centro en torno al cual se organiza todo el entramado urbano del viejo burgo. Construido en estilo románico en el siglo XII, fue reemplazado por el actual gótico a partir de 1276, siendo con sus 25 metros de alto y 15 de ancho el templo gótico de nave única más ancho y alto de Navarra. 

En 1276 año tuvo lugar la Guerra de la Navarrería que se saldó con la victoria del burgo de San Cernin sobre los demás burgos de la ciudad y con la destrucción de la Navarrería y del claustro de la catedral. En consecuencia, la construcción de la parroquia fue toda una declaración de intenciones del poder del burgo vencedor. Su construcción estuvo asociada a los apellidos más ricos y poderosos, como los Cruzat, cuyas sucesivas generaciones se enterraron delante del presbiterio de la iglesia, o los Deza, uno de cuyos miembros, Bernardo, alcalde del burgo en 1297, financió el coro, según dan fe su escudo de armas y una inscripción conmemorativa.

De este modo, siguiendo la práctica habitual, la construcción del templo comenzaría por la cabecera hacia 1276, continuándose posteriormente hasta los pies, levantados hacia 1297. A continuación, se trabajaría en la portada, en la base de las torres y en las bóvedas. Para el año 1400 la parroquia estaría prácticamente concluida, faltando por completarla, por el lado sur, con un claustro, al igual que otras parroquias pamplonesas como San Lorenzo.  

El interior llama la atención por su gran unidad espacial. En planta el templo presenta una nave única formada por dos tramos rectangulares y una cabecera semioctogonal con cinco capillas radiales: las tres centrales semioctogonales y las de los extremos cuadradas, que ocupan el nivel inferior de las dos torres que flanquean la cabecera. Estas capillas fueron completadas por otras dos, la de San Jorge y la de Santa Ana, de planta cuadrada y más pequeña, de las que solo sobrevive la de San Jorge. Este planteamiento de iglesia fue totalmente novedoso, ya que en Navarra hay muchas iglesias góticas de nave única (Santa María de Olite, San Saturnino de Artajona, la Asunción de Miranda de Arga, San Salvador de Sangüesa, Santa María de Ujué), pero sus cabeceras no tienen capillas radiales. Según señalan Martínez Álava y Fernández-Ladreda, este tipo de cabecera resultó también excepcional en España, existiendo una posible copia en Castellón, en la iglesia de San Mateu. 

Respecto a las bóvedas, la cabecera y las tres capillas centrales se cubren con bóvedas radiales que reproducen la planta semioctogonal y las capillas cuadradas con bóveda de crucería simple. Por su parte, la nave central emplea bóvedas sexpartitas. Llama la atención el empleo de un tipo de bóveda propias de la segunda mitad del siglo XII en un templo del gótico radiante. Según los citados Martínez Álava y Fernández-Ladreda, una posible razón de ello es que la nave estaría pensada para ser cubierta por una techumbre de madera a dos aguas soportada por arcos diafragma. Sin embargo, la decisión de cubrir la iglesia con bóvedas de piedra obligó a sus promotores a introducir este tipo de cubrición, ya que no resultaba viable construir una bóveda de crucería simple a la moda del XIV en una nave tan ancha, con los tramos tan próximos entre sí y con los muros tan irregulares. La inclusión de bóvedas sexpartitas también hizo que, al pesar más, hubiese que levantar los muros sin vanos, colocando contrafuertes angulares y rectos a los pies del templo.