El objetivo principal de la Unidad de Formación Clínica es planificar y coordinar la docencia de diferentes asignaturas del Grado en Medicina, colaborando con los departamentos básicos de la Facultad de Medicina y los departamentos clínicos de la Clínica Universidad de Navarra.
Asimismo, coordina el Trabajo Fin de Grado y el Programa de Alumnos Internos.
La Unidad de Formación Clínica también organiza actividades de postgrado dirigidas a la formación de Médicos Internos Residentes.