Servicios de apoyo
Proteómica, Genómica y Bioinformática
01
Asesoramiento para el abordaje
de investigaciones en proteómica
02
Realizacion de geles
monodimensional y bidimensional para tinciones de Coomasie, Sypro Ruby o Western Blot
03
Análisis comparativos
de proteomas en base a electroforesis bidimensional con tecnología DIGE
04
Tratamiento de muestras
proteicas: precipitacion y digestion
05
Identificaciónde proteínas
06
Estudio de mezclas
de proteinas de mediana y altacomplejidad
07
Identificación de algunas
modificaciones postraduccionales (ESI/MS/MS) como fosforilaciones, metilacioners, o acetilaciones
08
Caracterización de sustancias
(péptidos, azúcares, ácidos biliares, etc.) mediante espectrometría de masas
09
Caracterizacion de la masa
molecular de proteinas
10
Analisis cuantitativos
de proteomas complejos mediante marcaje iTRAQ
11
Cuantificacion de proteinas
mediante MRM
12
Cuantificacion de metabolitos
mediante MRM: nucleotidos de adenosina (APT, ADP, AMP) y poliaminas (espermidina, espermina y putrescina).
Además, se organizan periódicamente cursos prácticos de formación reconocidos por el Instituto Nacional de Proteómica (ProteoRed), la Sociedad Española de Proteómica (SeProt) y la Sociedad Española de Bioquímica (SEBBM).
Técnicas instrumentales: citometría, extracción de ácidos nucleicos, secuenciación
Los investigadores del CIMA y de la Universidad de Navarra pueden utilizar los servicios de la Unidad de Secuenciación de ADN, con arreglo a las siguientes normas:
Las muestras se enviarán debidamente identificadas, junto con un vale de compras y un formulario de petición debidamente cumplimentado en todos sus apartados. El vale de compras estará ya cumplimentado por el investigador, indicando el número de reacciones, el número de cuenta al que se efectuará el cargo y el nombre del investigador responsable de dicha cuenta. El formulario de petición se adjunta en este documento.
Para comprobar que la cantidad de ADN es suficiente, es imprescindible enviar también una imagen de un gel de agarosa de los productos de purificación enviados, indicando el volumen de carga de cada muestra. De modo orientativo, cuando 2 µL de una muestra producen una banda visible en un gel de agarosa estándar, se puede considerar que la concentración mínima de ADN en esa muestra está en torno a 5-10 ng/µL.
Si tras la separación electroforética sobra muestra y no es reclamada por el investigador que la ha enviado, ésta será destruida pasada una semana de su recepción.
A las 72 horas de la recepción de las muestras, el investigador recibirá en su correo electrónico los archivos con los electroforogramas (.ab1), que pueden ser analizados con cualquier visor de archivos .abi. No se enviarán secuencias en papel ni se intervendrá en la interpretación y/o estudios posteriores de los datos obtenidos.
En resumen, el investigador hará llegar a la Unidad de Secuenciación:
- Las muestras, bien etiquetadas y con la cantidad de ADN mínima indicada en el formulario.
- El formulario debidamente cumplimentado.
- Una imagen de un gel de agarosa representativo de la concentración de ADN en los productos de purificación.
- Un vale de compras debidamente cumplimentado.
Importante: Es obligatorio indicar concentración de la muestra