1. La secularización no es necesariamente un resultado exclusivo de la filosofía y la teología modernas, aunque representa un gran paso en esta dirección. El último período de la Edad Media también se había secularizado pero no en un sentido negativo, como en la temprana edad moderna. Hay que distinguir entre secularismo positivo y negativo. El secularismo negativo implica erradicar el reino de lo sagrado del mundo transformando este reino en un reino político, científico o de cualquier otro tipo. El secularismo positivo significa preservar la distinción y autonomía lícitas entre lo sagrado y lo profano y prevenir la confusión entre ambos reinos. El proyecto abordará el enfoque teórico de las hipótesis desarrolladas a este respecto por pensadores contemporáneos como Max Weber, Leo Strauss, Karl Löwith y Hans Blumenberg. Y asimismo contrastará su enfoque con los resultados de nuestra investigación para proponer alternativas a la difícil cuestión de la secularización del mundo moderno.

2. Habría que tener en cuenta la estrecha relación que se establece entre las argumentaciones teológicas, filosófico-científicas y políticas a la hora de articular y precisar el discurso acerca de la libertad. Para ello debemos de abordarlo de una forma interdisciplinar.

3. Las modernas revoluciones históricas dependían y estaban condicionadas por esta clase de interrelaciones en las argumentaciones.

4. El discurso contemporáneo sobre la libertad y la religión depende todavía de los argumentos de la temprana época moderna.

Carl Schmitt sugiere en su obra Teología Política (1922) -por primera vez en la historia- el concepto de teología política dentro de un marco teórico. Propone un campo de investigación en el que, para un entendimiento correcto de los conceptos jurídicos o políticos con toda su significación dentro del contexto de la modernidad, establezcamos analogías sistemáticas y metodológicas. A pesar de que no podemos tomar la obra de Schmitt como modelo único, esta hipótesis metodológica es muy fructífera a la hora de explorar el tema propuesto, como ha quedado demostrado en la literatura clásica. La "Begriffsgeschichte School"  dirigida por Reinhard Koselleck se inspiró de manera especial en esta idea.

Así pues, el método que el proyecto pretende desarrollar tiene tres aspectos fundamentales:

1. Que la imagen metafísica del mundo forjada por una época tiene la misma estructura que la forma de organización política entendida en ese momento como la más apropiada.

2. Que todos los conceptos significativos de la teoría moderna del estado son conceptos teológicos secularizados no solo debido a su desarrollo histórico sino también por su estructura sistemática.

3. Que la filosofía moderna, la filosofía política moderna y la historia política utilizan una forma teológica para legitimar la política.

Estas son las tres hipótesis metodológicas con las que trabaja la teología política. Erns Kantorowicz siguió estas hipótesis para el análisis del pensamiento político de la Edad Media. El equipo de ‘Religión y sociedad civil' busca desarrollar estas hipótesis metodológicas de una forma original considerando las diversas disciplinas