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Aplicaciones anidadas

Aplicaciones anidadas

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El Máster tiene una orientación práctica: desde el primer día, cada estudiante empezará un proyecto en su área de interés para aplicar en un caso real las herramientas informáticas que se explican en las asignaturas.

El TFM (30 ECTS) es un trabajo dirigido por un tutor, que previamente debe entrevistarse con el estudiante. Empieza a realizarse el primer día del curso y constituye el pivote en torno al cual gira el Máster.

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Trabajos Fin de Máster del curso 2021-2022

Título Departamento o Laboratorio Profesor responsable Estado

6. Análisis de imágenes experimentales mediante técnicas de inteligencia artificial

Dto. Física y Matemática Aplicada

Wenceslao González-Viñas

Disponible

7. Evaluación de la actividad eléctrica de la aurícula izquierda en pacientes con fibrilación auricular (tratamiento de imágenes biomédicas)

Dto. Física y Matemática Aplicada

Jean. R. Bragard

Disponible

9. Programación de robots para simular evacuaciones

Dto. Física y Matemática Aplicada 
Laboratorio Medios Granulares

Ángel Garcimartín Montero

Disponible

10. Sistema automatizado de diagnóstico por análisis de sangre

Dto. Física y Matemática Aplicada 
Dto. Microbiología

Ángel Garcimartín Montero

Disponible

15. Valoración cuantitativa de la motilidad manual de pacientes con Parkinson

Dto. Física y Matemática Aplicada 

Javier Burguete Mas

Asignado

16. Wind Turbine Wind Speed and Active Power Short-Term Forecasting: State of the Art, Forecasting Model, and Web Application

Dto. Física y Matemática Aplicada 

Sergio Ardanaz-Trevijano Moras

Disponible

19. Aplicaciones computacionales de la Agregación de T-subgrupos e indistinguibilidades

Dto. Física y Matemática Aplicada 

Jorge Elorza

Asignado

20. Estudio numérico de espirales en tejido cardiaco

Dto. Física y Matemática Aplicada 

Jean Bragard

Disponible


* El listado de trabajos se actualiza con asiduidad

Título Departamento o Laboratorio Profesor responsable Estado

1. Uso de datos masivos de hepatocarcinoma para estratificar pacientes y predecir nuevas estrategias terapéuticas

Unidad de Bioinformática

Puri Fortes

Asignado

3. Explorando las relaciones evolutivas en el reino animal mediante caracteres moleculares: filogenias controvertidas y especies crípticas Dto. Biología Ambiental David Galicia Paredes Asignado

11. Estudio del microambiente tumoral de linfomas B mediante análisis de scRNAseq

Dto. Bioquímica y Genética

Sergio Roa

Asignado

12: Optimización de un predictor de respuesta a inmunoterapia de linfoma difuso, usando machine-learning con datos de transcriptómica

Dto. Bioquímica y Genética

Francisco Javier Novo Villaverde

Asignado

13. Predicting the cellular composition and molecular makeup of the neurovascular unit using machine learning methods

Programa Biología Computacional

Mikel Hernáez

Asignado

18. Aplicaciones de deep learning y open hardware en etología: anotación automática de patrones conductuales en modelos animales de enfermedades neurológicas y neurodegenerativas

Systems Neuroscience LAB

Miguel Valencia

Asignado

21. Systems biology approaches for the treatment of mutant KRAS gastrointestinal tumors with dismal prognosis Programa Tumores Sólidos, CIMA · Programa Biología Computacional CIMA Silvestre Vicent Asignado
22. Studying the transition from Myelodisplastic syndrome to Acute Myeloid from a transcriptomics point of view Computational Biology Tecnun Fernando Carazo Asignado
23. Deciphering Alternative Splicing and DNA Methylation Association in Head and Neck Squamous Carcinoma Computational Biology Tecnun Fernando Carazo Asignado
25. A Bioinformatic Methodology to Identify small Circular RNAs. Terapia Génica y regulación de la expresión génica Tomás Aragón Asignado


* El listado de trabajos se actualiza con asiduidad

Título Departamento o Laboratorio Profesor responsable Estado

2. Desarrollo de nuevos materiales adsorbentes selectivos y aplicación en el tratamiento de aguas

Dto. Química

José Ramón Isasi

Asignado

8. In silico toxicology: an overview of computational methods for the genotoxicity prediction of a series of bioactive compounds

Dto. Tecnología y Química Farmacéuticas

María Font

Disponible

24. Microfluídica de hidrogeles: optimización del proceso, caracterización y aplicaciones Química y Física y Matemática Aplicadas José Ramón Isasi Asignado


* El listado de trabajos se actualiza con asiduidad

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Trabajos Fin de Máster del curso 2020-2021

Título Departamento o Laboratorio Profesor responsable Estado

Fibras textiles naturales y artificiales: estudio estructural durante sus procesos de degradación físico-química y biológica

Dto. Química
Grupo SUMBET

Adrián Durán

Disponible

Desarrollo y aplicación de fotocatalizadores mediante técnicas de recubrimiento químico y evaluación de sus rendimientos en procesos de eliminación de contaminante

Dto. Química
Grupo SUMBET

Francisco Javier Peñas Esteban

Disponible

Diseño de mezclas aplicado a materiales basados en polisacáridos

Dto. Química
Grupo SUMBET

José Ramón Isasi Allica

Disponible

In silico toxicology: an overview of computational methods for the genotoxicity prediction of a series of bioactive compounds

Dto. Tecnología y Química Farmacéuticas

María Font

Disponible

Estudio físico-químico y mineralógico de azulejos del siglo XIII procedentes del Castillo de Tiebas (Navarra)

Dto. Química
Grupo SUMBET

Adrián Durán

Asignado

Estudios de bioequivalencia entre formas farmacéuticas y nuevas formulaciones

Dto. Química
Grupo SUMBET

Itziar Vélaz

Disponible

Evaluación de la capacidad bactericida de films con nanopartículas de titania en diferentes condiciones experimentales

Dto. Química
Grupo SUMBET

Itziar Vélaz

Disponible

Aplicación del diseño de experimentos al rendimiento fotocatalítico de recubrimientos multifuncionales para materiales de construcción

Dto. Química

José Ignacio Álvarez Galindo
Iñigo Navarro Blasco

Asignado

Efectos del depósito de Nitrógeno atmosférico en los ecosistemas vulnerables mediterráneos: importancia de la fracción orgánica

LICA
Dto. Química

David Elustondo Valencia

Disponible


* El listado de trabajos se actualiza con asiduidad

Título Departamento o Laboratorio Profesor responsable Estado

Análisis del impacto de las especies acuáticas invasoras de la Península Ibérica

Dto. Biología Ambiental

Rafael Miranda

Disponible

Automatización en la detección de landmarks en estructuras craneales de mamíferos para el análisis de patrones morfológicos

Dto. Biología Ambiental

David Galicia

Disponible

Análisis de la sensibilidad de distintos procedimientos SDM a la degradación de la información biológica y ambiental accesible

Dto. Biología Ambiental

David Galicia

Disponible

Explorando las relaciones evolutivas en el reino animal mediante caracteres moleculares: filogenias controvertidas y especies crípticas

Dto. Biología Ambiental

David Galicia

Disponible

Inteligencia artificial para la identificación de fauna de suelo por “Deep learning”

Dto. Biología Ambiental

Arturo Ariño

Disponible

Cambios en los ecosistemas paleárticos inducidos por el nitrógeno reactivo ambiental

Dto. Biología Ambiental

Arturo Ariño

Disponible

Optimización de redes neurales convolucionales para la cuantificación retroactiva de los niveles de polen atmosférico 

Dto. Biología Ambiental

Arturo Ariño

Disponible

Georreferenciación, automatización y datos sensibles de las colecciones de historia natural

Dto. Biología Ambiental

Arturo Ariño

Disponible

Caracterización fina del efecto de “isla térmica” en una ciudad: el caso de Pamplona

Dto. Biología Ambiental

Arturo Ariño

Disponible

Reconstrucción de series de datos para dinámica de poblaciones

Dto. Biología Ambiental

Arturo Ariño

Disponible

Distribución biogeográfica de alcaudón real (Lanius meridionalis) en Península íbérica, análisis del flujo génico, endogamia y estructura poblacional

Dto. Biología Ambiental

Mª Angeles Hernández Minguillón

Disponible

Efectos del uso del suelo y de las perturbaciones antropogénicas sobre la composición y diversidad funcional de comunidades vegetales

Dto. Biología Ambiental

Ricardo Ibáñez

Disponible

Conocimientos tradicionales relativos a la biodiversidad

Dto. Biología Ambiental

Rita Yolanda Cavero Remón

Disponible

Análisis de patrones morfológicos de germoplasma en plantas características de ecosistemas mediterráneos

Dto. Biología Ambiental

Rita Yolanda Cavero Remón

Disponible

Highthrough statistical analysis of molecular mass data of humic acids from different origins obtained by Orbitrap-high resolution mass spectrometry

Dto. Biología Ambiental

Oscar Urrutia

Disponible

Análisis de la relación estructura química-actividad biológica de materias orgánicas para agricultura sostenible

Dto. Biología Ambiental

Marta Fuentes

Disponible

Título Departamento o Laboratorio Profesor responsable Estado

Medicina de precisión para la identificación de nuevas dianas terapéuticas mediante la integración de experimentos ómicos

Plataforma de Bioinformática del CIMA

Elizabeth Guruceaga Martínez

Disponible

Medicina personalizada de precisión para el tratamiento del mieloma múltiple empleando técnicas de Deep Learning (aprendizaje profundo) Plataforma de Bioinformática del CIMA Víctor Segura Ruiz Disponible
Uso de inteligencia artificial para estratificar pacientes con hepatocarcinoma e identificar terapias basadas en RNAs largos no codificantes  CIMA Puri Fortes Disponible
Diagnóstico de células infectadas mediante análisis de imágenes Dto. Física y Matemática Aplicada Angel Garcimartín Disponible
Statiscal inference of clonal mutation and the impact of Clonal neoantigen burden in the immune response Dto. Inmunología e Inmunoterapia (CIMA) Ibon Tomayo Disponible
Bioinformatic identification and prioritization of neoantigens to develop personalized immunotherapies  Dto. Inmunología e Inmunoterapia (CIMA) Sandra Hervas Disponible
Comparison of single-nucleotide variants identified by Illumina and Oxford Nanopore technologies in the context of B-cell-receptor (BCR) profiling  Dto. de Bioquímica Sergio Roa Disponible
Elucidating transcriptional rewiring via machine learning models  CIMA Mikel Hernáez Asignado
Determinación de la supervivencia neuronal mediante un programa automatizado de análisis de imágenes Dto. Neurociencias Montse Arrasate Disponible
Supervised learning with single-cell RNAseq data  Dto. Ingeniería Biomédica Idoia Ochoa Disponible
Dimensionality reduction techniques or MS imaging data  Dto. Ingeniería Biomédica Idoia Ochoa Disponible
Metanalysis of RNA binding proteins implicated in cancer development CIMA Igor Ruiz de los Mozos Disponible
RNA binding proteins to lncRNA knowledge graph CIMA Igor Ruiz de los Mozos Disponible
Mejora de la biodistribución cerebral de vectores de alta capacidad  Terapia Génica CIMA Rubén Hernández Alcolea Asignado
Elucidating Abiraterone response on patients with Prostate Cancer via Machine Learning methods CIMA Mikel Hernáez Asignado
Deep learning to elucidate a key mechanism to overcome cellular stress CIMA Tomás Aragón Disponible
Systems biology approaches for the treatment of lung cancer patients lacking driver oncogenes  CIMA Silvestre Vicent Disponible
Genomic and bioinformatic analysis of transcriptomic changes that govern brain metastasis and response to radiotherapy in lung cancer CIMA Alfonso Calvo Asignado
Analisis of somatic variant calls common across different tumor samples  TECNUN / CIMA Idoia Ochoa
Iban Tamayo
Disponible


* El listado de trabajos se actualiza con asiduidad.

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Muchos profesores de diversas áreas ofrecen títulos de TFM que están dispuestos a supervisar. Alternativamente, el estudiante puede buscar un profesor dispuesto a dirigir un trabajo de su interés que no esté incluido en esta lista y proponerlo como TFM. Algunos ejemplos:

Aplicaciones anidadas

tfm-1

Sistema automatizado de diagnóstico por análisis de imágenes
 

El proyecto persigue elaborar un kit de diagnóstico de bajo coste con el fin de detectar, mediante análisis de imágenes en una muestra biológica, algunas enfermedades de especial incidencia en países pobres (tuberculosis, malaria, etc.).

Sistema automatizado de diagnóstico por análisis de imágenes

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tfm-3

Análisis de la sensibilidad de distintos modelos de distribución de especies a la degradación de la información biológica y ambiental disponible

Conocer las limitaciones que los métodos más frecuentemente utilizados en la literatura tienen ante la calidad de la información de entrada, con el fin de decidir cuál es la herramienta más adecuada a utilizar en función de los datos primarios disponibles.

Análisis de la sensibilidad de distintos modelos de distribución de especies a la degradación de la información biológica y ambiental disponible

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tfm-2

Medicina personalizada de precisión para el tratamiento del mieloma múltiple empleando técnicas de Deep Learning (aprendizaje profundo)

En este proyecto se propone emplear datos de RNA-Seq, DNA-Seq y datos clínicos para diseñar un nuevo sistema de estratificación de pacientes con mieloma múltiple basado en el empleo de autoencoders.
 

Deep Learning

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tfm-4

Modelización de la cinética de fotodegradación catalítica en medios acuosos
 

El trabajo consistirá en desarrollar modelos cinéticos generales de fotodegradación que tengan en cuenta otras sustancias presentes en el medio acuoso.

 

Modelización de la cinética de fotodegradación catalítica en medios acuosos

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