Trabajos Fin de Máster. Máster en Métodos Computacionales en Ciencias. Facultad de Ciencias. Universidad de Navarra

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El Máster tiene una orientación práctica: desde el primer día, cada estudiante empezará un proyecto en su área de interés para aplicar en un caso real las herramientas informáticas que se explican en las asignaturas.

El TFM (30 ECTS) es un trabajo dirigido por un tutor, que previamente debe entrevistarse con el estudiante. Empieza a realizarse el primer día del curso y constituye el pivote en torno al cual gira el Máster.

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Trabajos Fin de Máster del curso 2022-2023

Área de Física y Matemática Aplicada

Título	Departamento o Laboratorio	Profesor responsable	Estado
2. Control del movimiento colectivo de partículas autopropulsadas mediante energía foltovoltaica	Dto. Física y Matemática Aplicada	Iker Zuriguel Ballaz	Disponible
4. Thermodynamic cycles with magnetotactic bacteria	Dto. Física y Matemática Aplicada	Reinaldo García García	Disponible
9. Programación de minirobots para simulación de atascos	Dto. Física y Matemática Aplicada	Ángel Garcimartín Montero	Disponible
18. Computational Mechanistic based Modelling applied to the development of Oncolytic virus	Dto. Tecnología y Químicas Farmacéuticas	José Ignacio Fernández de Trocóniz Fernández	Asignado

Área de Bioinformática

Título	Departamento o Laboratorio	Profesor responsable	Estado
3. Al-based computational pathology applied to digitized patient biopsies	Anatomía Patológica (CUN)	Carlos E de Andrea	Asignado
7. Búsqueda de biomarcadores de última generación para el diagnóstico temprano y estimación del pronóstico de pacientes con colangiocarcinoma (El TFM se desarrolla en San Sebastián).	Enfermedades Hepáticas y Gastrointestinales	Jesús María Bañales	Disponible
8. Predicción de aptámeros con alta afinidad y especificidad in silico	3.06	Fernando Pastor	Asignado
10. Uso de datos masivos de hepatocarcinoma para desarrollar nuevas estrategias terapéuticas	406 CIMA / UNAV	Puri Fortes	Asignado
11. Deconvolving the DMG tumor microenvironment from spatially resolved transcriptomics using Deep Learning models	Dto. Biología Computacional	Mikel Hernáez	Asignado
12. Deep learning para la anotación automática de patrones conductuales en primates no humanos	Systems Neuroscience Lab. CIMA.	Miguel Valencia	Asignado
16. Implementation of RNAseq-based approaches to define T cell states and clonality of immunotherapy responses in lymphoma	Bioquímica y Genética	Sergio Roa	Asignado

Adquisición y análisis de datos en Biología, Química y Medio Ambiente

Título	Departamento o Laboratorio	Profesor responsable	Estado
1. Fenología de la fauna del MSS en el pre-Pirineo	Dto. Biología Ambiental	Enrique Baquero	Disponible
5. Desarrollo de nuevos materiales adsorbentes selectivos y aplicación en el tratamiento de aguas	Dto. Química	José Ramón Isasi	Disponible
6. Desarrollo de nuevas metodologías limpias para la fabricación de fertilizantes fosfatados	Dto. Biología Ambiental	José Mª García-Mina Freire	Asignado
13. Automatización en la detección de landmarks en estructuras craneales de mamíferos para el análisis de patrones morfológico	Dto. Biología Ambiental	David Galicia Paredes	Disponible
14. Análisis de la sensibilidad de distintos procedimientos SDM a la degradación de la información biológica y ambiental accesible	Dto. Biología Ambiental	David Galicia Paredes	Asignado
15. Explorando las relaciones evolutivas en el reino animal mediante caracteres moleculares: filogenias controvertidas y especies críptica	Dto. Biología Ambiental	David Galicia Paredes	Disponible

Trabajos Fin del Máster del curso 2021-2022

Área de Física y Matemática Aplicada

Título	Departamento o Laboratorio	Profesor responsable	Estado
6. Análisis de imágenes experimentales mediante técnicas de inteligencia artificial	Dto. Física y Matemática Aplicada	Wenceslao González-Viñas	Disponible
7. Evaluación de la actividad eléctrica de la aurícula izquierda en pacientes con fibrilación auricular (tratamiento de imágenes biomédicas)	Dto. Física y Matemática Aplicada	Jean. R. Bragard	Disponible
9. Programación de robots para simular evacuaciones	Dto. Física y Matemática Aplicada Laboratorio Medios Granulares	Ángel Garcimartín Montero	Asignado
10. Sistema automatizado de diagnóstico por análisis de sangre	Dto. Física y Matemática Aplicada Dto. Microbiología	Ángel Garcimartín Montero	Disponible
15. Valoración cuantitativa de la motilidad manual de pacientes con Parkinson	Dto. Física y Matemática Aplicada	Javier Burguete Mas	Asignado
16. Wind Turbine Wind Speed and Active Power Short-Term Forecasting: State of the Art, Forecasting Model, and Web Application	Dto. Física y Matemática Aplicada	Sergio Ardanaz-Trevijano Moras	Disponible
19. Aplicaciones computacionales de la Agregación de T-subgrupos e indistinguibilidades	Dto. Física y Matemática Aplicada	Jorge Elorza	Asignado
20. Estudio numérico de espirales en tejido cardiaco	Dto. Física y Matemática Aplicada	Jean Bragard	Disponible

Área de Bioinformática

Título	Departamento o Laboratorio	Profesor responsable	Estado
1. Uso de datos masivos de hepatocarcinoma para estratificar pacientes y predecir nuevas estrategias terapéuticas	Unidad de Bioinformática	Puri Fortes	Asignado
3. Explorando las relaciones evolutivas en el reino animal mediante caracteres moleculares: filogenias controvertidas y especies crípticas	Dto. Biología Ambiental	David Galicia Paredes	Asignado
11. Estudio del microambiente tumoral de linfomas B mediante análisis de scRNAseq	Dto. Bioquímica y Genética	Sergio Roa	Asignado
12: Optimización de un predictor de respuesta a inmunoterapia de linfoma difuso, usando machine-learning con datos de transcriptómica	Dto. Bioquímica y Genética	Francisco Javier Novo Villaverde	Asignado
13. Predicting the cellular composition and molecular makeup of the neurovascular unit using machine learning methods	Programa Biología Computacional	Mikel Hernáez	Asignado
18. Aplicaciones de deep learning y open hardware en etología: anotación automática de patrones conductuales en modelos animales de enfermedades neurológicas y neurodegenerativas	Systems Neuroscience LAB	Miguel Valencia	Asignado
21. Systems biology approaches for the treatment of mutant KRAS gastrointestinal tumors with dismal prognosis	Programa Tumores Sólidos, CIMA · Programa Biología Computacional CIMA	Silvestre Vicent	Asignado
22. Studying the transition from Myelodisplastic syndrome to Acute Myeloid from a transcriptomics point of view	Computational Biology Tecnun	Fernando Carazo	Asignado
23. Deciphering Alternative Splicing and DNA Methylation Association in Head and Neck Squamous Carcinoma	Computational Biology Tecnun	Fernando Carazo	Asignado
25. A Bioinformatic Methodology to Identify small Circular RNAs.	Terapia Génica y regulación de la expresión génica	Tomás Aragón	Asignado

Área de Biología y Medio Ambiente

Título	Departamento o Laboratorio	Profesor responsable	Estado
4. Análisis de la sensibilidad de distintos procedimientos SDM a la degradación de la información biológica y ambiental accesible	Dto. Biología Ambiental	David Galicia Paredes	Disponible
5. Automatización en la detección de landmarks en estructuras craneales de mamíferos para el análisis de patrones morfológicos	Dto. Biología Ambiental	David Galicia Paredes	Disponible
14. Análisis de la efectividad del desarrollo del programa europeo LIFE y otras ayudas internacionales en la conservación de la biodiversidad	Dto. Biología Ambiental	Rafael Miranda	Asignado
17. Explotación de los datos de Biodiversidad obtenidos en un muestreo en el MSS de la Sierra de Guadarrama	Dto. Biología Ambiental	Enrique Baquero	Disponible
26. Desarrollo e implementación de una nueva herramienta de ayuda a la toma de decisión para el desarrollo de las energías renovables marinas, bajo el enfoque de la planificación espacial marítima	Dto. Biología Ambiental	Ibon Galparsoro	Disponible

Área de Química

Título	Departamento o Laboratorio	Profesor responsable	Estado
2. Desarrollo de nuevos materiales adsorbentes selectivos y aplicación en el tratamiento de aguas	Dto. Química	José Ramón Isasi	Asignado
8. In silico toxicology: an overview of computational methods for the genotoxicity prediction of a series of bioactive compounds	Dto. Tecnología y Química Farmacéuticas	María Font	Disponible
24. Microfluídica de hidrogeles: optimización del proceso, caracterización y aplicaciones	Química y Física y Matemática Aplicadas	José Ramón Isasi	Asignado

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VÍDEOS - TRABAJO FIN DE MÁSTER

Aplicaciones anidadas

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Julen Torrens

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Sergio León

Aplicaciones anidadas

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Iván Ruiz

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Irene Marín

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Muchos profesores de diversas áreas ofrecen títulos de TFM que están dispuestos a supervisar. Alternativamente, el estudiante puede buscar un profesor dispuesto a dirigir un trabajo de su interés que no esté incluido en esta lista y proponerlo como TFM. Algunos ejemplos:

Aplicaciones anidadas

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Sistema automatizado de diagnóstico por análisis de imágenes

El proyecto persigue elaborar un kit de diagnóstico de bajo coste con el fin de detectar, mediante análisis de imágenes en una muestra biológica, algunas enfermedades de especial incidencia en países pobres (tuberculosis, malaria, etc.).

Sistema automatizado de diagnóstico por análisis de imágenes

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Análisis de la sensibilidad de distintos modelos de distribución de especies a la degradación de la información biológica y ambiental disponible

Conocer las limitaciones que los métodos más frecuentemente utilizados en la literatura tienen ante la calidad de la información de entrada, con el fin de decidir cuál es la herramienta más adecuada a utilizar en función de los datos primarios disponibles.

Análisis de la sensibilidad de distintos modelos de distribución de especies a la degradación de la información biológica y ambiental disponible

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Medicina personalizada de precisión para el tratamiento del mieloma múltiple empleando técnicas de Deep Learning (aprendizaje profundo)

En este proyecto se propone emplear datos de RNA-Seq, DNA-Seq y datos clínicos para diseñar un nuevo sistema de estratificación de pacientes con mieloma múltiple basado en el empleo de autoencoders.

Deep Learning

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Modelización de la cinética de fotodegradación catalítica en medios acuosos

El trabajo consistirá en desarrollar modelos cinéticos generales de fotodegradación que tengan en cuenta otras sustancias presentes en el medio acuoso.

Modelización de la cinética de fotodegradación catalítica en medios acuosos

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