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presentacion bioinformatica

El grupo de Biología Computacional de Tecnun es un equipo multidisciplinar, con gran experiencia en el desarrollo de algoritmos de optimización, análisis estadístico, así como métodos basados en machine learning y deep learning, principalmente enfocados en cuestiones del ámbito de la salud humana a través de datos de alta resolución molecular (genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, etc) y bases de datos biológicas (genómicas, farmacológicas, metabólicas, etc). Actualmente, estamos trabajando en las siguientes temáticas:

 Reprogramación metabólica en cáncer con el fin de identificar nuevas dianas terapéuticas y marcadores de respuesta.

 Integración de experimentos masivos de silenciamiento génico y fármacos en el marco de la oncología de precisión.

 Estudio del splicing alternativo en distintos tipos de cáncer: sus alteraciones, causas y efectos.

 Modelos predictivos de toxicidad de fármacos basados en características estructurales.

 Influencia de la microbiota intestinal en el ámbito de la salud y nutrición.

 Esquemas de compression específicos para diferentes datos ómicos. Miembros activos en el desarrollo del standard MPEG-G para la representación de datos genómicos. 

 Análisis de datos de ADN. Métodos para mejorar la identificación de variantes biológicas en germline y cancer.

 Inferencia de redes de regulación de genes para datos de RNA provenientes de secuenciación en bulk y single-cell.

 Caracterización de HERV (human endogenous retroviruses) en cancer y muestras de cerebro.

Durante estos años, hemos colaborado activamente con distintos centros de investigación y empresas. Los más relevantes son: CIMA, Clínica Universidad de Navarra, CIC BioGUNE, Biodonostia, FISABIO, Onkologikoa, Universidad de Granada, Celgene, Biobide, Universitat Politècnica de Catalonia, University of Illinois at Urbana-Champaign, Stanford University, y Universidad de la República (Uruguay).

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Miembros del grupo Computational Biology

Miembros del grupo

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Ángel Rubio Díaz-Cordovés

Catedrático

(Coordinador)

+34 943 219877 Extensión: 842802

Ver CV "Ver CV de Ángel Rubio Díaz-Cordovés"

Francis Planes Pedreño

Catedrático

 

+34 943 219877 Extensión: 842802

Ver CV "Ver CV de Francis Planes Pedreño"

Juan Angel Ferrer-Bonsoms Hernández

Profesor Ayudante Doctor

 

+34 943 219877 Extensión: 842997

Idoia Ochoa Álvarez

Profesora Colaboradora

 

+34 943 219877 Extensión: 842845

Ver CV "Ver CV de Idoia Ochoa Álvarez"

Guillermo Serrano Sanz

Post-doc

 

+34 943 219877

Naroa Barrena Acuña

Doctoranda

 

+34 943 219877 Extensión: 842937

Francesco Balzerani

Doctorando

 

+34 943 219877

Laura Jareño Ajona

Doctoranda

 

+34 943 219877 Extensión: 842875

Naroa Legarra Marcos

Doctoranda

 

+34 943 219877

Carlos Javier Rodríguez Flores

Doctorando

 

+34 943 219877

Katyna Sada Del Real

Doctoranda

 

+34 943 219877 Extensión: 842928

Joseba Sancho Zamora

Doctorando

 

+34 943 219877 Extensión: 842928

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