El Departamento de Filosofía de la Universidad de Navarra, de acuerdo con la Identidad y Misión de la Universidad, tiene como función buscar la excelencia en el desarrollo de la investigación y la docencia en el campo de la Filosofía.

La misión del Departamento se dirige a impulsar la actividad investigadora y docente de sus profesores y la formación de los alumnos de Grado, Máster y Doctorado en Filosofía. Adicionalmente, proporciona formación filosófica a alumnos de otros centros, principalmente a través de la colaboración con el Instituto Core Curriculum y la Facultad de Teología. Por último, provee al resto de disciplinas de la Universidad de un sustento teórico y una visión global e integradora de los saberes.

El Departamento pretende encarnar con un compromiso especial los valores del amor a la verdad, la coherencia de pensamiento y vida, la libertad y la responsabilidad y la cultura del diálogo y la tolerancia, difundiendo los valores de la Universidad en la sociedad y colaborando con otros centros universitarios en la docencia e investigación.