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Biología computacional

Biología de sistemas - Oncología

El Grupo de Biología Computacional de TECNUN es un equipo multidisciplinar con una amplia experiencia en el desarrollo de algoritmos de optimización, análisis estadísticos, así como métodos de aprendizaje automático y aprendizaje profundo, aplicados a diferentes problemas biológicos. Nos centramos principalmente en la salud humana mediante la integración de datos de alto rendimiento (genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, etc.) y bases de datos biológicas (genómica, farmacológica, metabólica, etc.). A continuación se proporciona una instantánea de los proyectos en los que estamos trabajando actualmente.

  • Reprogramación metabólica en cáncer para la identificación de nuevas dianas terapéuticas y biomarcadores de respuesta.

  • Oncología de precisión. Integración de silenciamiento génico a gran escala y experimentos farmacológicos.

  • Empalme alternativo en cáncer. Alteraciones, causas y efectos.

  • Modelos predictivos de toxicidad de fármacos basados ​​en características estructurales de las moléculas.

  • Influencia de la microbiota intestinal en el contexto de la salud y la nutrición.

  • Esquemas de compresión adaptados a diferentes datos ómicos. Miembros activos del desarrollo del estándar MPEG-G para la representación de información genómica.

  • Análisis de secuenciación de ADN. Métodos para mejorar la línea germinal y la llamada de variantes somáticas.

  • Inferencia de la red reguladora de genes (GRN) para datos de RNAseq a granel y unicelulares.

  • Caracterización de HERV (retrovirus endógenos humanos) en muestras de cáncer y cerebro.

Colaboramos activamente con diferentes centros de investigación y empresas. Entre otros, se enumeran CIMA, Clínica Universidad de Navarra, CIC BioGUNE, Biodonostia, FISABIO, Onkologikoa, Universidad de Granada, Celgene, Biobide, Universidad Politécnica de Cataluña, Universidad de Illinois en Urbana-Champaign, Universidad de Stanford y Universidad de la República ( Uruguay).

 

Visor de contenido web (Global)

Miembros Grupo Computational Biology

 

Ángel Rubio Díaz-Cordoves

Subdirector

Computational Biology

Extensión: 2810

Ver CV "Ver CV de Ángel Rubio Díaz-Cordoves"

Francis Planes Pedreño

Profesor Titular

Computational Biology

Extensión: 2802

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Carlos Castilla Ruiz

Investigador post-doctoral

Computational Biology

943219877

Idoia Ochoa Álvarez

Profesor Colaborador

Computational Biology

943219877

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Fernando José Carazo Melo

Ayudante Doctor

Computational Biology

Extensión: 2864

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Iñigo Apaolaza Emparanza

Ayudante Doctor

Computational Biology

Extensión: 2870

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Luis Vitores Valcárcel García

Estudiante de doctorado

Computational Biology

943219877

Xabier Cendoya Garmendia

Estudiante de doctorado

Computational Biology

943219877

Francesco Balzerani

Estudiante de doctorado

Computational Biology

943219877

Juan Ferrer-Bonsoms Hernández

Estudiante de doctorado

Computational Biology

943219877

María de los Ángeles Gimeno Cobarro

Estudiante de doctorado

Computational Biology

943219877

Naroa Barrena Acuña

Estudiante de doctorado

Computational Biology

943219877

Telmo Blasco Aramburu

Estudiante de doctorado

Computational Biology

943219877