unidad-metabolomica-texto

Unidad de Metabolómica

La Unidad de Metabolómica presta servicio a todas las áreas del centro en aquellas investigaciones relacionadas con metabolitos y sus variaciones frente a diferentes causas. La metabolómica es dentro de las ciencias-ómicas la que estudia el metaboloma y los cambios que se producen en él cuando se le somete a estímulos externos: enfermedad, dieta, condiciones ambientales, etc.

La metabolómica se clasifica en dos grandes enfoques: metabolómica dirigida y metabolómica no dirigida. En el primer caso, se estudia la cuantificación de unos determinados metabolitos concretos y conocidos. En cambio, la metabolómica no dirigida quiere dar respuesta a la pregunta de ¿Cuál es el perfil metabólico global de una muestra?, y por extensión ¿Cómo se ve afectado ese perfil metabólico frente a un cambio externo?.

Algunos ejemplos de hipótesis iniciales en un estudio metabolómico no dirigido en el campo de la nutrición pueden ser:

  • ¿Cómo cambia el metaboloma de un individuo antes y después de un estudio de intervención nutricional?

  • ¿Cómo afecta la ingesta de un complemento alimenticio (por ejemplo, ácido lipoico) a los individuos frente al grupo placebo?

  • ¿Qué metabolitos son los discriminantes entre los diversos grupos de mi proyecto?

Ambas aproximaciones no son excluyentes, en un primer momento puede efectuarse un análisis metabolómica no dirigido para identificar los metabolitos de interés. Una vez establecidos dichos metabolitos se puede efectuar una aproximación dirigida para cuantificar dichos metabolitos.

La Unidad de Metabolómica se ha especializado en estudios metabolómicos no dirigidos, debido a que se considera que es la aproximación que puede aportar valor en la investigación de mecanismos moleculares, y en el descubrimiento de nuevos biomarcadores de enfermedad y dieta.

Una parte muy importante, especialmente al trabajar en la metabolómica no dirigida, es el procesamiento de los datos. Para ello se utilizan software específicos para efectuar el alineamiento de los picos cromatográficos que se obtienen en los análisis. Posteriormente, para el estudio final de los datos se usan herramientas estadísticas multivariante; algunas de estas herramientas son propias de Big Data, como el Análisis de Componentes Principales (PCA), Regresión de Mínimos Cuadrados Parciales-Análisis Discriminante (PLS-DA), modelo RandomForest, modelo Support Vector Machine (SVM), HeatMap, etc.

bloque-personal-tecnico-unidad

PERSONAL TÉCNICO DE LA UNIDAD

texto-personal-tecnico-unidad

Ana Romo Hualde
Responsable de la Unidad.

Dra. en Ciencias Químicas

 

 

David Muñoz Prieto
Técnico.

Graduado en Ciencias Químicas

bloque-equipos

EQUIPOS

texto-equipos

→ HPLC – TOF: HPLC 1200 acoplado a detector de masas TOF 6220 Accurate –Mass LC/MS


 

→ UPLC – Qtrap 5500: UPLC Acquity H-Class (Waters) acoplado a detector de masas QTRAP 5500 (Sciex).


 

bloque-proyectos

PROYECTOS

texto-proyectos

→ microBIOMICS: Estudio metabolómico relacionado con microbiota en diversos tipos de muestras biológicas

→ EHGNA: Estudio metabolómico no dirigido en suero en relación con hígado graso

→ PREDISMET: Estudio metabolómico no dirigido en medio de cultivo de diversas cepas

→ LIKIDI: Estudio metabolómico no dirigido en suero en humanos

→ BIOPRO: Estudio metabolómico no dirigido en suero de ratas sobre extracto rico en polifenoles.

→ NUTRICIA: Estudio metabolómico no dirigido en plasma inicio y final intervención en humanos. Estudio lipidómica.

→ CIBENA calabaza: Estudio metabolómico no dirigido procesos fermentativos in vitro.

→ BIOTAGUT: Estudio metabolómico no dirigido en heces inicio y final intervención en humanos, ratones y procesos fermentativos in vitro.

→ miRNABIOTA: Estudio metabolómico no dirigido en suero en humanos antes y después de intervención nutricional.

→ NUTRAGEN: Estudio metabolómico no dirigido en suero de ratas sobre diversos extractos de origen vegetal.

→ NUTRIGENIO: Estudio metabolómico no dirigido en plasma inicio y final intervención en humanos.

→ OBEBACS: Estudio metabolómico no dirigido en suero de ratas sobre diversos extractos de origen vegetal.

→ SIMBIOTPLUS: Estudio metabolómico no dirigido efectuado sobre piensos

contacto-unidad-metabolomica

Contacto

Ana Romo Hualde

Unidad de Metabolómica

C/ Irunlarrea, 1

31008 Pamplona, España

+34 948 425600

Ext. 806351

Contactar