La investigación científica es el motor de la docencia universitaria. En la Facultad de Ciencias existe una muy estrecha relación entre la investigación que desarrollan los profesores y la docencia que se imparte a los alumnos.
La investigación en la Facultad de Ciencias se desarrolla de manera multidisciplinar en distintas áreas de la ciencia en general: biología, gestión medioambiental, química y biomaterilaes, biomedicina, genética y biología celular, matemáticas, biofísica, bioinformática, ...
La Facultad de Ciencias está situada en la zona del campus universitario dedicada a las ciencias experimentales y de la salud, donde trabaja estrechamente con las Facultades de Medicina y Farmacia, la Clínica Universitaria de Navarra (CUN) y otros centros de investigación de la Universidad, como el Laboratorio Integrado de Calidad Ambiental (LICA), el Centro de Investigación Médica Aplicada (CIMA), el Centro de Investigación en Farmacobiología Aplicada (CIFA), el Instituto de Biología Aplicada (IBA), la Unidad de Biología de Tumores Cerebrales (UBTC), el Servicio de Análisis Genéticos,... Así, varios Departamentos universitarios son interfacultativos.
Departamentos de la Facultad de Ciencias: